外伤性脑脓肿的治疗需要根据脓肿的部位以脓肿的是否形成薄膜，采取不同的治疗方案。

如果外伤性的脑脓肿处于脑炎期薄膜还没有形成，这时候可以选择敏感的抗生素，抗生素的使用原则是容易透过血脑屏障，并且对于治病菌是敏感的，一般需要使用最大的量，最长的疗程。

对已有薄膜形成的脓肿，应及时施行手术治疗。对病程长、脓肿壁厚、位于非功能区的脓肿或包裹有异物的脓肿，手术将脓肿连同异物一并切除是较彻底的治疗方法。对病程短、脓壁薄，位于脑重要功能区且不含异物者的脓肿，大多采取穿刺引流的手术。