临床上面，脊髓栓系综合症的表现比较复杂，主要是由于脊髓圆锥受牵拉的时间和程度不同，可以导致不同的神经功能障碍的表现。

最为常见的是疼痛。儿童为腰骶部岀现难以描述的疼痛或者不适，可以呈放射状向下肢放射。成年人疼痛的部位相对广泛一些，表现为触电样和放射性的疼痛。另一大症状是运动障碍，主要是下肢进行性的肌无力并行走困难，可伴有废用性的肌肉萎缩，或者是肌张力的增高，有人为一侧，也有为双侧的。有些会有鞍区的皮肤麻木或感觉的障碍。

有些人会出现尿频、尿急、尿失禁、尿潴留及便秘等膀胱直肠功能障碍。大部分儿童患者还可以发现腰骶部的皮肤异常，多毛症及皮下的脂肪瘤等。