阴囊根部到肛门很痛，考虑是前列腺发生炎症引起的。

阴囊部位到根部发生疼痛，大多数是由前列腺炎引起的。因为男性的阴囊根部，与肛门的位置比较近，当前列腺发生炎症反应时，导致局部充血、水肿，可引起会阴部位疼痛，牵扯到肛门附近也会有疼痛感。患者通常伴有尿频、尿急、排尿疼痛、排尿等待等临床症状。

完善前列腺液常规检查、前列腺B超就可以明确诊断，可给予左氧氟沙星、前列舒通胶囊等药物治疗。平时可用温水坐浴，按摩前列腺可缓解疼痛。