肚子疼痛的原因有很多，多数是胃肠道疾病导致的，例如肠易激综合征。该病患者主要表现为大便不成形，反复肚子疼，但是在排气或者排便后疼痛缓解。

进食辛辣、生冷刺激性食物或者情绪波动较大时容易出现肚子疼。也可能是功能性胃肠疾病。这一类疾病患者平时在进食辛辣油腻刺激性食物时会引起胃肠道阵发性痉挛，导致腹部疼痛。有一部分幽门螺杆菌患者会出现间断腹部疼痛，胃镜和肠镜检查均未见异常病变。腹部疼痛可由该菌引起。还可由肝胆疾病，例如胆囊炎、胆囊结石等，或者阑尾炎、泌尿系结石等均可引起腹部疼痛，但是这些疾病在查体时多有明显的体征表现。