卡尔曼综合征的后遗症临床表现为三个方面：

第一，性腺功能减退：多数男性患者下部量大于上部量，呈类宦官体型。外生殖器幼稚状态，阴茎短小，睾丸小或者隐睾，青春期第二性征发育缺如。女性患者内外生殖器均发育不良，青春期时无乳房发育，无腋毛、阴毛生长，无月经来潮。

第二，嗅觉缺失或减退。

第三，相关躯体异常表现：包括面中线发育缺陷如唇裂、腭裂、肾脏发育异常等。