窦房结自律性升高的原因大部分和器质性疾病因素引起有关系。

常见的原因主要是器质性心脏病本身引起，比如心脏病或者心脏瓣膜病引起心力衰竭的情况下，由于交感神经兴奋，会导致窦房结自律性升高，引起窦性心动过速心律失常发生，导致心跳加快。此外部分急性的心肌损伤改变也会引起窦房结自律性升高，比如心肌炎或者急性心肌梗死，这些疾病都会引起窦房结的自律性升高，导致窦性心动过速、心律失常发生。

少数患者的窦房结自律性升高引起窦性心动过速发生，往往找不到明确的发病原因，医学上把这种情况称之为不恰当的窦性心动过速。