目前没有研究能够明确的表明，长期服用避孕药和胆管结石之间存在必然的联系，但是从口服避孕药的副作用以及胆管结石的成因来分析，长期口服避孕药会使胆管结石的患病率增加。

胆管结石的成因主要是因为胆汁淤积和胆系感染后，胆囊内的胆固醇等物质浓度增加，沉淀形成结石。长期口服避孕药的人群会导致维生素吸收障碍，从而影响体内胆固醇的代谢，导致胆囊内胆固醇的浓度增加诱发结石。

口服避孕药还可能使人产生恶心、呕吐及食欲不振等症状，导致饮食不规律，胆汁不能及时排出胆囊，增加结石发病的概率。