头顶右边阵痛的原因主要有以下这几种可能：

1.偏头痛。本病是一种血管神经性的头痛，主要是颅内外的痛觉敏感结构受到了刺激而引发的。发病的时候，患者会出现头顶部右边阵痛的症状，是一种波动性、阵发性加剧的疼痛，而且常常伴有恶心、呕吐等症状。

2.颅内肿瘤。随着颅内肿瘤的增长，有可能会诱发疼痛。当颅内压越来越高的时候，患者可能出现右边的阵痛越来越严重的症状。通过颅脑的核磁共振检查，可以确诊这一点。

3.血压突然增高。此时颅内血管扩张、痉挛，有可能也会表现为头顶右边阵痛。