脑源性晕厥可以根据病史和临床表现不难做出诊断，如果有过经窦道及经窦道排出过死骨更易诊断。拍摄X线片证实有无死骨可以了解形状、数量、大小和部位以及附近包壳生长情况，也可作CT或者核磁共振检查。

还要和以下疾病相鉴别，首先反射性晕厥是晕厥中最常见的一种，再就是血管迷走神经反射性晕厥，其次还有排尿性晕厥、及直立性低血压性晕厥。

另外临床上还能见到颈动脉窦反射过敏性晕厥及咳嗽性晕厥，常在剧咳中突然发生。最为严重的是心源性晕厥。