深呼吸时心脏不舒服平常需要及时到医院就诊，以明确引起心脏不舒服的病因，再根据病因进行针对性的治疗。

深呼吸时心脏不舒服通常是由于心源性或者是肺源性疾病引起，常见的心源性疾病有冠心病、感染性心内膜炎、心包炎、瓣膜性心脏病等，可通过超声心动图、肌钙蛋白、心肌酶、心电图等检查明确诊断。常见的肺源性疾病有大叶性肺炎、支气管扩张、胸水、胸膜炎以及肺动脉高压等，可以通过胸部X线检查、血生化、肺功能检查等明确诊断。

无论是心源性或肺源性疾病引起心脏不适，在治疗基础疾病的同时需要结合休息、吸氧、维持电解质平衡等支持治疗。