小孩发高烧39℃时手脚还是凉的，主要是由于以下几种因素所导致：

1.由于小孩较小末梢循环较差，在发热的时候就会出现身体发热以及手脚冰凉的现象。

2.因为小孩的体温调节能力差，血管神经系统发育不成熟所导致的。

3.由于发生了上呼吸道感染或者其他的感染之后，而引起的一种急性发烧，此时也会导致小孩出现手脚冰凉的现象。

小孩高烧39℃手脚还是冰凉的，要及时采取相应的措施。是由于发生了感染而导致，要及时采取抗感染治疗以及服用退烧药物治疗。在采取对症治疗的过程中，要给小孩多饮水，这样可以促进退烧，可控制疾病。