当孕期检查出胎儿双侧脉络丛囊肿该如何处理，这种情况需要结合孕妇的具体情况来进一步分析。

胎儿脉络丛囊肿，可能合并胎儿18三体和21三体综合征，但是大部分胎儿脉络从囊肿会在妊娠26周以后消失，只有极少数会进行性增大，并且合并胎儿染色体畸形。

如果是单纯的脉络丛囊肿常常没有明确的病理意义，不合并有其它胎儿结构畸形时，往往预后良好，这种情况建议孕妇先进行无创DNA产前检查，并根据检查结果决定下一步治疗。

但是如果是孕妇有其中之一的高危因素，比如：

1.母亲年龄大于等于35岁。

2.同时有其它胎儿结构畸形。

3.唐氏筛查高风险。

4.合并有其它染色体异常指标。

有以上任意情况存在时，应考虑进行羊水穿刺检查染色体核型是否有异常决定下一步治疗。