小便时刺痛，可能为尿路感染、尿路结石、尿路损伤等因素所导致。

如果存在尿路感染疾病，比如膀胱炎或者是尿道炎，在炎症感染加重以后，会对膀胱或者是尿道黏膜造成严重的损伤。在排尿时，由于尿液的刺激，就可引起小便刺痛，还会伴有其他症状，比如尿频、尿急等，严重时还会出现肉眼血尿。

如果存在尿路结石，比如尿道结石，结石会对尿道造成损伤，就可引起小便刺痛，可能还伴有排尿困难、尿频等症状。如果泌尿系统遭受了急性外伤，导致局部软组织损伤，在排尿时也可出现刺痛。