贲门恶性肿瘤的治疗主要有手术、靶向治疗、放疗等多种手段，具体需要结合分期、肿瘤大小进行确定。

如果贲门恶性肿瘤处于比较早期，暂时没有出现广泛的周围组织、远端组织转移，被局限在贲门内。首选根治性手术治疗，可以单纯切除肿瘤，也可以将食道下端、近端胃部组织进行切除，然后重建消化系统，大部分患者都能够康复痊愈。

如果是病情严重发生多部位、器官转移，则需要采取靶向治疗、放疗、化疗等方式进行综合性治疗，缓解症状，提升生存周期。