感染乙肝病毒后，有两种情况可以清除乙肝病毒。

1.依靠自身免疫系统清除乙肝病毒，这也是急性感染乙肝后，绝大部分患者会出现的情况。

2.是慢性乙肝感染。这类情况机体自身免疫系统已经不能清除乙肝病毒了，只能通过药物来治疗乙肝病毒。药物中干扰素是直接抗乙肝病毒作用，能够杀灭乙肝病毒，但是要完全清除乙肝病毒，使乙肝表面抗原转阴非常困难，只有极少部分人能完全清除乙肝病毒。其他药物如核苷类似物，只能将乙肝病毒抑制，而不能彻底清除乙肝病毒。