间质性膀胱炎常见并发症是膀胱容积量缩小以及输尿管道狭窄梗阻，从而导致排尿间隔时间明显缩短，输尿管反流、肾积水、肾盂肾炎等病变。较为严重的并发症是影响肾脏的滤过代谢功能，导致肾功能衰竭。

相关并发症的发生，跟膀胱纤维化改变有关，导致膀胱挛缩、输尿管腔狭窄，排尿间隔时间明显缩短，影响日常生活以及夜间睡眠质量。可给予萘哌地尔、托特罗定等药物对症治疗，而改善症状。

必要时还需要考虑膀胱扩大手术、膀胱造瘘等治疗措施。