新冠病毒感染可引发新冠肺炎，主要感染部位是肺部，常见的临床表现有发热、干咳、乏力，严重者可一周内出现呼吸困难。

肺部影像学检查可见早期两肺多发斑片影，以肺外带明显，然后出现毛玻璃样改变，病灶浸润出现肺实变等。

除此以外新冠肺炎有些患者可出现腹泻、头痛等，在粪便、尿液、脑脊液检查里陆续检测到新冠病毒，随着尸检的进行，发现新型冠状病毒除了侵犯肺部，还可以影响免疫系统、中枢神经系统、男性生殖系统等其他器官。