内脏血吸虫病的主要危害有：

一、累及结肠：血吸虫病病变以直肠、乙状结肠和降结肠最为严重。早期的时候黏膜充血、水肿，可以出现溃疡。当患者合并慢性感染时，出现纤维组织增生、肠壁增厚，引起肠息肉和结肠狭窄，肠系膜增厚、短缩可以并发肠梗阻。如果虫卵沉积于阑尾，可以诱发阑尾炎。

二、导致肝脏病变：早期肝脏充血肿胀，可以有虫卵结节，晚期由于虫卵结节形成纤维组织，肝内门静脉周围形成广泛的纤维化，进而导致肝硬化的发生。

三、脾脏：脾脏早期有充血、水肿，晚期由于肝硬化门脉高压，导致脾脏组织增生、巨脾。