药物治疗膀胱炎是有副作用的。

膀胱炎的药物治疗，主要是应用抗生素抗感染，在使用抗生素时，最常见的副作用是出现药物过敏反应。患者可以表现为皮疹，局部瘙痒等症状，比较严重的患者甚至可以出现过敏性休克。

对于使用喹诺酮类药物的患者，有可能出现肾功能损害、血尿等不良反应。其他的药物也可以出现肝功能损害、肾功能损害。部分抗生素可以出现耳毒性等并发症，所以在使用抗生素治疗膀胱炎的情况下也需要非常谨慎。