在临床上，能够导致肛门有隐约疼痛感的疾病有很多，具体如下：

1.如果肛门部位存在炎症或感染现象，当炎症或者感染向肠道内部蔓延时，部分敏感的患者则可能会感觉到肛门有隐约痛感。若及时采取治疗措施，临床症状即可随之减轻。

2.如果存在内痔或者肛裂的现象，排便时由于会对病变部位造成刺激，患者也会因此出现隐隐约约疼痛的感觉。

3.如果肛门部位存在外伤，若伤口较小，部分情况下也会感觉到肛门有隐隐疼痛的感觉。