肠瘘可以由肠道梗阻引起，但也有可能是因为其它疾病导致的。当肠瘘发生时，肠道内容物会通过瘘口溢出肠腔，引起腹部感染、剧烈的腹痛、肠道功能障碍以及水电解质平衡紊乱等临床症状。

肠瘘发病的基础是肠壁破裂，常见的引起肠壁破裂的疾病有肠壁外伤、严重的肠道炎症、肠道恶性肿瘤以及肠道术后感染等。

当发生肠道梗阻后，特别是粘连性肠梗阻，肠道内容物增多，肠腔内压力增加，肠道的蠕动通常会变快，有可能引起粘连的肠壁撕裂、破损，在机体炎性物质的作用下形成肠瘘。