精囊结石的治疗方式需要根据结石的大小、有无引起相应症状来决定，如果精囊结石的体积较小，并且没有引起明显的临床症状时，此时一般可以不用治疗。

当精囊结石引起输精管梗阻，导致炎症发作时，此时需要应用抗生素抗感染来治疗，可以配合使用激素治疗，有效的控制炎症，并且可以减轻梗阻所致的水肿，有利于输精管的通畅，并且可以使精液的质量得到有效的改善。

如果精囊结石体积较大，并且合并其它疾病时，此时可以行手术治疗，将精囊及结石同时切除，手术的方式可以选择精囊镜手术。