大便后肛门疼痛由多种情况导致，需要根据不同病因，采取不同的药物，对症对因治疗：

1.肛裂。肛裂是肛门皮肤破损形成的小溃疡，典型症状为肛门部周期性疼痛，对于肛裂患者，可以口服镇痛剂、钙离子通道阻滞剂和血管扩张剂等药物治疗。

2.肛周脓肿。对于脓肿尚未完全成熟或脓肿较小的情况，服用抗感染、镇痛药物治疗，可以取得良好的效果。

3.痔疮。一些痔疮会造成肛门便后疼痛，一般不需要采取手术治疗，可以口服促进消化的药物，防止大便干结而加重疼痛感，还可以口服镇痛药物或中成药物联合调理。