睡醒耳洞流脓提示患者耳洞存在化脓性炎症感染，建议做以下的治疗：

1.建议耳鼻喉科门诊医生应用双氧水或者医用酒精或者医用碘伏，反复行耳洞局部的消毒处理，将局部的脓性感染分泌物清理干净。

2.再用抗生素软膏进行局部的涂抹治疗，临床上可以应用复方多粘菌素B软膏或者百多邦软膏涂抹治疗。

3.如果创面比较大，可以用无菌纱布做局部的外敷处理，减少空气中的细菌、灰尘等污染耳洞的局部。

4.可以全身口服或者静脉应用抗生素进行消炎治疗。