乳头状囊腺瘤有发生癌变的可能。主要见于病史较长、病情复杂，当患者出现病变部位长期慢性炎症刺激后，可能导致病变恶化。

此时，需要及早手术将病变组织切除，通过病理检查对病变作进一步分析。手术中应当适当扩大切除范围，尽量将病变组织完整切除，防止术后复发。

手术后根据病理检查决定是否辅助后续治疗方案。如果为良性病变，手术结束。如果为恶性病变，要根据病理检查、免疫组化检查，采取后续治疗措施，争取稳定病情，延长患者生存时间。