在临床上精囊脓肿是很少见的，病因不是十分清楚，但是可能的易感因素包括糖尿病患者长期留置导尿、内镜操作以及解剖异常如输精管精囊内异位开口。这种疾病的主要致病因素为泌尿生殖道的感染，如急性的慢性的附睾炎、尿路感染等，体内远处感染灶也可以通过血行播散引起精囊的脓肿。在临床上已经证实77%的精囊脓肿都是由大肠杆菌引起的，此外还有沙雷杆菌、金黄色葡萄球菌、分枝杆菌等。