绿脓杆菌性角膜溃疡，需要频繁的滴用高浓度抗菌眼药水。可以配置妥布霉素或者头孢他定滴眼液，再联合喹诺酮类药物，如氧氟沙星或者是左氧氟沙星、加替沙星等眼液频繁滴用。

最初可以每5分钟一次，持续30分钟，然后每30分钟一次，并根据临床反应减少点眼次数。再全身应用抗生素如妥布霉素，头孢他啶等等。对于溃疡进行性发展，药物治疗效果不佳，角膜溃疡后弹力层膨出或穿孔患者，则需要及时行穿透性的角膜移植手术，以控制眼睛状况。