盲袢综合征和短肠综合征不一样，是两种疾病。

盲袢综合征是小肠内食糜存留时间过长，细菌在小肠内过度繁殖导致的，主要与肠道解剖结构改变和肠道动力异常有关，比如胃大部切除术后的患者和糖尿病患者以及甲减的患者容易出现盲袢综合征。这类患者主要表现为腹痛、腹泻，严重时会导致营养不良和贫血。

短肠综合征是小肠吸收能力下降导致的，主要和手术、遗传缺陷有关，切除不同部位的小肠带来的后果也不一样。空肠切除过多容易导致营养元素吸收障碍，回肠切除过多容易导致腹泻、巨幼红细胞性贫血以及脂肪吸收不良。而且短肠综合征时容易发生小肠细菌过度生长，容易诱发盲袢综合征。