肝癌晚期做抽腹水治疗时，会产生以下的副作用：

1.白蛋白的大量丢失。造成患者出现严重的低蛋白血症，或者是原有的轻度低蛋白血症发展到重度，导致腹水、水肿等症状加重。

2.抽取腹水后会导致肝癌患者出现高凝血的状态。患者的D-二聚体等凝血因子指标明显高于正常值，导致抽水后肝癌患者容易发生静脉血栓或者是肺栓塞等严重并发症，从而危及生命。

3.晚期抽腹水还可以导致抽水处局部感染，出现发烧等副作用。