出现手指甲盖发黑，主要的原因如下：

首先是甲营养不良的患者，存在甲营养不良，就容易盖有发黑的表现。很有可能是缺乏微量元素，比如缺锌和缺钙，所以要针对性的进行治疗。如果存在贫血，还会导致指甲盖上有发白的表现。所以要从饮食结构中，进行针对性的补充。

其次是真菌感染，在平时不注重清洁卫生，受到了真菌感染，也容易导致手指甲盖发黑，需要积极的进行抗感染治疗。并且要注重在存在严重指甲疾病的时候，及时的到医院接受外科处理。