肝包虫病的初期症状不明显，当包虫囊增大到一定程度时，可出现压迫症状。如肝顶部囊肿使隔上升，挤压肺而影响呼吸，肝后囊肿压迫下腔静脉或门静脉，导致下肢浮肿、腹水、脾肿大。

肝下囊肿挤压胃肠道，发生饱胀、恶心、呕吐等。当囊肿溃破时表现囊肿溃破入胆管，因破碎囊膜或子囊阻塞胆道，合并感染，可反复出现寒热、绞痛、黄疸。

溃破入腹腔，除发生腹膜炎外，由于囊液内所含毒白蛋白，常致过敏，重者过敏性休克。溃破入胸腔可发生胸膜炎，进而破入支气管，可咳出含有胆汁的囊液，并形成支气管瘘。