小便的时候疼痛不建议同房，其原因包括：

1.可能有病原菌的感染，造成排尿疼痛。如果这时候同房，就有可能造成病原菌的播散，也就是将病原菌传染给伴侣，造成伴侣有共同症状。所以最好是能够彻底治疗，等待症状完全消失以后再同房，减少传染的概率。

2.疼痛的时候，可能会存在生殖器黏膜的水肿或者炎性反应。同房过程中，由于局部充血或者摩擦过度等因素，都可以造成原有病变范围进一步扩大，从而造成症状进一步加重。所以不建议同房，建议积极治疗。

3.同房过程中有可能会感染新的疾病。也就是通过伴侣传染其他的病原菌，造成本来只是单纯性的感染，这时变成复杂性的感染，从而造成病情加重或者治疗困难。