新生儿肝炎和胆道闭锁的区别很大。

1.新生儿肝炎通常是指从母亲这里感染了乙肝，而导致的母婴传播的乙肝感染，可能会出现消化道症状以及黄疸的症状。

2.新生儿胆道闭锁是指肝脏内胆管或肝外胆管发育异常，胆管存在闭锁的解剖结构异常，导致胆汁流通不畅，从而反流入血引起的黄疸。

所以虽然这两种疾病都是可能会有黄疸的症状，但是其导致黄疸的根本原因、发病机制完全不同，其治疗也是完全不同。新生儿肝炎需要护肝降酶以及对因治疗，而新生儿胆道闭锁则需要外科手术治疗，将胆道闭锁的胆管通过外科手术将其打开，使之胆道结构恢复正常。