慢性肺炎根据病原菌的不同，可以分为肺炎链球菌肺炎、金黄色葡萄球菌肺炎、支原体肺炎、衣原体肺炎、军团菌肺炎、病毒性肺炎、克雷伯杆菌肺炎，不同的肺炎临床表现以及痰液不同、影像学表现也不同、治疗有所不同。

通常肺炎链球菌肺炎咳铁锈色痰首选青霉素g治疗，金黄色葡萄球菌通常是脓血痰，选择半合成青霉素或头孢菌素治疗。肺炎克雷伯杆菌肺炎痰液是砖红色痰，首选氨基糖苷类，如庆大霉素治疗。

军团菌肺炎、支原体肺炎、衣原体肺炎首选大环内酯类，如红霉素、罗红霉素、阿奇霉素治疗。病毒性肺炎首选抗病毒治疗，如利巴韦林、阿昔洛韦等治疗。