棘阿米巴性巩膜炎是由棘阿米巴角膜炎发展而来，临床表现为角膜上皮混浊，假树枝状或局部点状荧光素染色。随着病情进展，角膜呈现中央或旁中央环状浸润。

炎症加重时浸润致密呈不规则片状，甚至形成脓肿、角膜溃疡、溶解。炎症侵犯到骨膜表现为弥漫性前巩膜炎。少数患者表现后巩膜炎、神经炎。

临床症状一般较重。若长时间持续高眼压，则容易形成巩膜葡萄肿。棘阿米巴性巩膜炎药物或手术治疗效果不佳。严重者可导致失明。