新鲜肛裂治疗相对容易、疗程短、效果理想，采用非手术疗法即可，一般治疗原则是软化大便，缓解精神紧张，可以通过调节饮食结果，多摄取富含膳食纤维的食物，避免辛辣、刺激、油腻食物，适当服用缓泻剂。

陈旧性肛裂最好采用手术疗法，手术目的是清除陈旧性的创面变成新鲜创面，以有利于愈合，切断部分痉挛的肛门内括约肌，减轻疼痛，使创面引流通畅，同样有利于创面愈合，能够同时处理并发症，达到完全治愈。

手术的方法根据侧重点不同，分为肛裂切除术、内括约肌切断术、肛裂切除带蒂皮瓣转移术等。