双肾都有小结石时治疗方法与单侧肾结石相同，由于结石较小存在有自行排出的可能，所以暂时可不予以手术治疗，患者应该从以下几方面来治疗促进结石排出：

第一，改善生活及饮食习惯，增加日饮水量，最好是白开水，以增加尿量和排尿次数，避免进食含草酸盐或钙盐丰富的食物，避免导致肾结石逐渐增大、增多，增加运动量以促进结石排出。

第二，到泌尿外科就诊，完善相关检查评估病情，在医生的指导下口服排石颗粒等药物排石治疗。

虽然肾脏结石较小，但由于结石形态常不规则，所以在排石过程中仍然可能会出现结石嵌顿在输尿管狭窄处的情况，一旦发生应及时到泌尿外科就诊。