确定新冠变异病毒的最准确方法，是通过病毒分离，测定样本当中新冠病毒的基因序列，是否与原有新冠病毒基因序列相同。如果经检测，样本当中新冠病毒的基因序列产生较大差异，则可以确定为新冠变异病毒。

除直接测定新冠病毒基因序列外，还可通过新冠病毒在外界表现特点进行前期判断，如新冠病毒的流行趋势、易感人群特点、感染后患者的临床症状等。

如与原有新冠病毒的特点存在较大差异，需要考虑存在新冠病毒变异可能性。