有多个直肠息肉首先就是进行病理组织学的检查，在确定需求的性质之后再决定治疗的方案。

如果息肉是属于炎症性的息肉，也就是由于直肠黏膜组织发炎导致了伴随性的息肉生长。可以治疗原发的疾病，肠道内炎症消退之后息肉也有自行消失的可能。

如果息肉是属于肿瘤性质的息肉，比如绒毛状的腺瘤，可以进行切除的治疗防止息肉发生癌变，可以在肠镜下切除，也可以在直视下进行切除。

如果直肠息肉是属于增生性的息肉，一般都是由于细胞增殖所引起，可以先观察为主，增生性的息肉一般不会产生临床症状，如果短时间内有快速的增长可以考虑做切除的治疗。