膀胱炎大多为细菌感染所引起，因此主要是通过口服抗菌类的药物进行治疗，比如喹诺酮类或者是头孢菌素类的抗菌药物，主要包括头孢地尼、左氧氟沙星等。由于膀胱炎会引起明显的膀胱刺激征，还可通过口服碳酸氢钠片碱化尿液，减少酸性尿液对于尿道和膀胱的刺激。如果膀胱痉挛疼痛的症状比较严重，还可通过口服阿托品、地西泮等药物予以缓解。

如果女性膀胱炎由于雌激素缺乏所引起，可以通过使用雌激素替代疗法进行辅助治疗，增加乳酸杆菌，降低膀胱炎的发病几率。