肺曲菌病的类型不同，其治疗措施不同：

第一、曲菌球，频繁和大量咯血时推荐手术切除，合并基础疾病和肺功能损害不能耐受手术者，可采用支气管动脉栓塞止血，抗曲霉菌的药物全身应用疗效不肯定，口服伊曲康唑可能有效。

第二、侵袭性的肺曲菌病选用下列药物伊曲康唑、卡泊芬净和米卡芬净，药物选择参考临床病型严重程度，患者免疫状态以及病情好转的速度，药物的安全性以及价格等因素综合考虑。