激光碎石常见的手术方法有输尿管镜碎石术以及经皮肾镜碎石术，其中输尿管镜碎石术是将输尿管镜从尿道伸入到输尿管中，找到结石后使用激光将结石击碎，这种手术由于会损伤尿道以及输尿管黏膜，容易引起尿路感染。

如果患者输尿管狭窄或者操作不当，有可能导致输尿管穿孔、撕裂等，但是出现的情况一般比较少。

经皮肾镜碎石术是在腰部打一个造瘘口，然后将镜子伸入到肾脏里面，使用激光将结石击碎，然后让结石排出，这种手术也可能出现感染、粘膜损伤。

其中最严重的的是出现大出血，这种情况一般需要通过介入治疗，严重者还可能要将肾脏摘除。