舌根右侧疼有可能是局部出现了溃疡，与牙齿摩擦导致的疼痛，可以口服药物治疗，也可以使用喷雾剂局部用药。上火也会导致舌根疼，可以吃清热泻火的药物治疗症状。

也有可能是右侧舌根的软组织出现了拉伤，在说话或者吃饭的时候牵动舌头，导致出现疼痛，这种情况需要在医生指导下进行治疗。

此外，一些疾病也会导致舌根出现牵连性的疼痛，比如扁桃体炎。积极治疗原发病后，舌根疼痛的现象就会相应得到缓解。