涎腺的未分化癌的具体发病原因不详，有些患者可能和基因的缺陷有关，有可能会发生遗传。但是根据临床资料的统计分析，发生遗传的风险很低，大部分患者发生涎腺的未分化癌和后天的因素比较大。

涎腺的未分化癌主要累及大涎腺，和口腔内的刺激有关，比如有些人长期进食辛辣的食物，有些人可能有口腔内的病毒感染，有些人长期接触有害射线也可以导致涎腺发生癌变。

基因在肿瘤的发生过程中发挥着重要的作用，所以遗传因素可能会有一定的作用。