非淋菌性尿道炎的潜伏期一般在一周到三周的时间，平均潜伏期大约为十到十四天。

如果在进行了不洁性交之后的十四天左右出现了排尿疼痛及尿道口有分泌物，这种情况就应考虑存在尿道炎，通过分泌物涂片及培养检查，排除淋菌性尿道炎后，一般就可诊断为非淋菌性尿道炎。

非淋菌性尿道炎应从源头上进行防治，避免进行不洁性生活，当出现症状时要及时就诊，及时使用药物治疗，以避免较为严重的并发症出现。由于可以通过性交进行传播，因此在治疗期间不可以进行性生活。