扁桃体恶性肿瘤无遗传性，扁桃体恶性肿瘤的发生多是由后天的有害因素导致。

有些患者发生扁桃体恶性肿瘤和不良的生活习惯有关，比如有些患者长期大量吸烟、饮酒，烟酒可以刺激扁桃体发生恶变。有些患者可能有慢性的扁桃体的炎症，扁桃体慢性炎症也会对扁桃体的细胞造成刺激，发生癌变。

有些患者口腔内的病毒感染也可以对扁桃体造成刺激，导致扁桃体发生恶变。免疫力低下也可以导致扁桃体恶性肿瘤的发生，比如有些患者可以发生淋巴瘤。