5岁的男孩身高1米，属于矮小症。5岁的男孩，正常的身高的中间值应该在1.13米～1.15米之间。这个孩子明显低于这个值。所以他在矮小的范围。

要针对这个情况详细的询问病史，了解孩子最近2~3年之内生长的速率是多少，生长速率如果明显低于每年5公分，他的矮小确诊无遗。需要进一步的进行一些核磁共振的垂体检查，还有一些生长激素的激发试验，内分泌的一些情况的检查，综合判断以后给出一个诊断。

确定排除了内分泌的疾病完全的就是一个单纯的矮小，就可以给予生长激素的治疗。如果同时伴随有内分泌疾病的异常，在应用生长激素的过程中，也还要治疗内分泌的疾病。所以说他一定要去医院做一个全面的检查。