流感病毒有一定几率会引发耳鼻喉疾病。如中耳炎的病因之一就是上呼吸道的感染，在患有流感时，如果外界气体压力过大，病毒经过咽鼓管进入中耳，则容易引起中耳炎。

中耳炎的症状常为不同程度的耳痛、发热、耳朵内部有黄色或者粘稠红色的液体，也有可能出现食欲不振、上吐下泻等。

如果患者本身鼻腔内部有鼻中隔偏曲等异常情况，在流感病毒感染时很容易诱发鼻窦炎。鼻窦炎患者的主要症状为全身烦躁、发热、头痛、鼻塞、流脓涕和局部疼痛等。