全飞秒手术后可能出现过矫或者欠矫，目前全飞秒手术基本上已经用薄瓣分妙代替了常规飞秒手术。

飞秒手术的准确性非常高，并且手术时做的角膜皮瓣而更薄，因此对角膜的损害也更小。部分患者术后可能会出现眼睛干涩的症状，这是由于术中损伤了角膜神经。但这种情况会在一到三个月左右，角膜的恢复而逐渐好转。部分患者术后出现的眩光，也能在三个月左右恢复。

以上只是几种可能会出现的，后遗症并不是所有患者都会有，上述后遗症多能恢复正常。