龟头流脓可能为龟头炎、淋病、非淋菌性尿道炎等疾病所引起，如果不及时治疗，可能会逆行感染，引起前列腺炎、睾丸炎、精囊炎等生殖系统疾病。

如果为普通细菌感染所引起的龟头炎，患者应将龟头以及包皮内部清洗干净后，外涂百多邦软膏进行治疗，治疗周期为5~7天。如果是淋病病或非淋菌性尿道炎，主要为不洁的性生活所引起，应提取局部的分泌物进行细菌培养，根据致病菌的类型，选用相应的抗生素类药物进行治疗。

在治疗期间，应禁止性生活，多注意休息，清淡饮食。